14年前，初号机疑似神化第一形态的觉醒带来近三冲击，使世界发生前所未有的巨变。在此之后，葛城美里（三石琴乃 配音）等NERV旧部出走，成立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香（宫村优子 配音）和真里（坂本真绫 配音）夺回被封印在卫星轨道上的初号机和碇真嗣（绪方惠美 配音），但

　　高中生四月一日君寻（福山润 配音）有着令他十分困扰的灵异体质，他总是能在不知不觉的情况下吸引大量的灵体。一日，偶然中他踏进了一间魔法商店，遇见了美丽神秘的店主壹原郁子（大原沙耶香 配音）。郁子告诉他这是一件帮人达成愿望的商店，四月一日君寻遂许下了希望能解除特异体质的愿望，可是这愿望售价昂贵，四月

　　13岁的安倍昌浩（甲斐田雪 配音），是日本最伟大的阴阳师安倍晴明的孙子，作为晴明唯一继承者的他却没有什么法力——他不能看见妖怪。当他想放弃阴阳师之路，努力培养别的才能时，一直形似白猫的神秘小妖怪出现在他身边。与此同时，京都妖孽横行，于是爷爷委托昌浩去击退妖魔。没有法力的昌浩只好带着这只小猫怪，作

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美配音）和葛城美里（三石琴乃配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的

　　时间是近未来，地点是日本。　　警察部队正在追捕奇怪机器人带领的暴走集团，但在敌人的火力下，警方显得不堪一击。英勇应击的女警秋夏子名悬一线，幸好被突然出现的神秘女子救下。随后又有多起案件，同样是在警方束手无策时，神秘女子出手解决事件。原来，这位神秘女子是自称Cutie Honey拥有魔法能力的正义

　　在距現在不遠的未來東京---　　隨著這時代科技的進步, 人們已開始使用氫氣電池及人型機器人了　　雖然技術進步了,但犯罪檢舉率卻相反的降低,失業率上升等等的社會不安定也不斷增加　　外觀和現在林立的都市一樣....但, 實際上街道已經被混亂的陰影所?#092;罩了　　以這樣的東京為舞台,海空來,原田

　　13岁的少年刘昴星（田中真弓 配音）在料理方面具有极高的天赋，自从母亲去世后，他和姐姐合力经营菊下楼，过着平静自在的生活。然而一个不速之客打破了这一切，母亲的徒弟绍安意图霸占酒楼，经过一番料理对决，阿昴凭借高超的厨艺和对饮食的理解打败了绍安，也因此得到李提督（小杉十郎太 配音）的赏识。在此之后，

　　在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。　　数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一

2012年2月，东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅（20岁）和V仔兽修行拉面技艺的时候，遇到了虽然拿着有裂纹的数码器，但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽，我的搭档数码兽被我杀了，我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”

6年前の6月17日、降りしきる雨の中、黒崎一護の母・真咲は、一護に覆いかぶさるようにして原因不明の死を遂げた。真咲の命日、黒崎一家は真咲の墓参りに向かう。その日、一護は死神代行業を休むつもりでいたが、霊園では朽木ルキアが先回りをして一護のことを待ち構えていた。前日の夜、一護から母は「殺された」と聞か